Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3371F7CQW8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3371F7CQW8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms