Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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