Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gm28048F7BCN0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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