Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm9887F6RFI0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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