Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Urb2E9Q7L1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms