Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms