Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc8E9PWG2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms