Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms