Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm3-rs7D3Z2H9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms