Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms