Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms