Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cttnbp2B9EJA2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cttnbp2B9EJA2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms