Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyp26c1B2RXA7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms