Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah3B2RWG3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah3B2RWG3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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