Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Abcc8B2RUS7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms