Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud7bB2RUR8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms