Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usf3B2RUQ2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms