Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms