Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apol7aB2RT54 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apol7aB2RT54 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms