Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap42B2RQE8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap42B2RQE8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms