Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Uhrf1bp1B2KF50 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms