Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmem238A9JSM3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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