Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r232A2RTT5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r232A2RTT5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms