Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2al1jA2BFR3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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