Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scn3aA2ASI5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms