Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms