Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GabreA2AMW3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GabreA2AMW3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms