Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms