Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Frmpd1A2AKB4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms