Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms