Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms