Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0U1RNP2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms