Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms