Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac5Q9Z2V6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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