Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip6Q9Z1Y4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip6Q9Z1Y4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms