Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0X0

Cdc42ep5, Cdc42 effector protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms