Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnip1Q9WUU8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms