Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Tk2Q9R088 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tk2Q9R088 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms