Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AmfrQ9R049 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AmfrQ9R049 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms