Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp21Q9QZL6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp21Q9QZL6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms