Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ercc4Q9QZD4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms