Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc3Q9QZC1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpc3Q9QZC1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Trpc3Q9QZC1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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