Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnnt3Q9QZ47 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnnt3Q9QZ47 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms