Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpsf3Q9QXK7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms