Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Homer2Q9QWW1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms