Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms