Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrfQ9JM73 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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