Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms