Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cabp1Q9JLK7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms