Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn15Q9JLG8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn15Q9JLG8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms